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Sanger法测序原理和步骤PPT

Sanger法测序原理和步骤如下:Sanger法测序原理Sanger法测序的原理是基于DNA的变性、模板-引物复合物的形成、dNTP的合成以及电泳分离等过...
Sanger法测序原理和步骤如下:Sanger法测序原理Sanger法测序的原理是基于DNA的变性、模板-引物复合物的形成、dNTP的合成以及电泳分离等过程。下面将详细介绍这些步骤:1. DNA变性在Sanger法中,待测DNA首先需要被加热至90℃以上,使得DNA双链打开并分离成单链。这一步是必要的,因为后续的步骤都需要在单链DNA上进行。2. 模板-引物复合物的形成变性后的DNA单链被用作模板,与一段已知序列的引物结合形成模板-引物复合物。引物是人工合成的一段短的单链DNA,其序列与待测DNA模板的一端互补。当模板与引物在适当的温度下混合时,引物会与模板互补配对,形成稳定的模板-引物复合物。3. dNTP的合成在模板-引物复合物的基础上,DNA聚合酶可以催化以dNTP(脱氧核糖核苷三磷酸)为底物的聚合反应。在反应过程中,DNA聚合酶将单个的dNTP添加到引物3'端,形成新的子链。这个过程会一直进行,直到子链的长度达到预期。需要注意的是,每次添加的dNTP必须与模板上对应的碱基互补,以保证合成的子链与原始模板具有相同的序列。4. 电泳分离合成完成后,不同长度的子链将被进行电泳分离。由于不同长度的子链具有不同的迁移速率,因此可以通过电泳将它们分开并按照长度排序。最短的子链(对应于模板的最初几个碱基)迁移速度最快,而最长的子链(对应于模板的最后一个碱基)迁移速度最慢。通过这种方式,我们可以获得一份DNA序列的“指纹”,其中包含了待测DNA序列的所有信息。5. 数据分析最后,通过对比已知序列的引物和电泳分离得到的子链指纹图谱,我们就可以确定待测DNA的序列。通常情况下,Sanger法可以测定最多几百个碱基的DNA序列。然而,对于更长的DNA序列,通常需要采用其他的测序方法,例如Maxam-Gilbert法或下一代测序技术(NGS)。Sanger法测序步骤Sanger法测序的步骤可以分为以下几部分:1. DNA的提取和纯化首先需要从生物样本中提取出DNA。这一步骤可能需要用到一些生物化学的方法,比如细胞裂解、离心分离等。提取出的DNA往往含有一些杂质和污染物,如蛋白质、RNA等,因此需要进行纯化。纯化的方法有很多种,包括用酚-氯仿萃取、乙醇沉淀等。2. 片段化和标记接下来需要对纯化的DNA进行片段化和标记。这个步骤中,DNA将被打断成多个小片段,每个片段包含一定数量的碱基。为了能够标记这些片段,通常会用一个特定的酶(如T4 DNA聚合酶)来将一个放射性核素标记添加到新合成的DNA片段上。3. 变性和电泳分离然后是对标记的DNA进行变性和电泳分离。这个步骤中,DNA双链将被打开成为单链,并且根据它们的长度被分离开来。这个过程是通过将DNA加热到90℃以上并加入尿素等变性剂来实现的。然后这些单链DNA将被加入到一种叫做聚丙烯酰胺凝胶的介质中进行电泳分离。凝胶中的孔径大小是按照预设的顺序排列的,这使得不同长度的DNA片段能够在凝胶中移动的速度不同。最短的片段移动得最快,而最长的片段移动得最慢。4. 照相和数据分析最后是对凝胶进行照相和数据分析。通过放射性自显影技术可以将凝胶中的DNA片段位置显影出来并拍摄成照片。根据照片上每个放射性标记的位置,就可以确定每个DNA片段的长度。再结合已知的引物序列,就可以确定整个DNA序列。值得注意的是,这些步骤都是在严格的实验室条件下进行的,并且需要专业的技术人员来操作和分析结果。