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Sanger法测序原理和步骤PPT

Sanger法测序是一种经典的DNA测序技术,由弗雷德·桑格(Frederick Sanger)在1975年首次提出。该方法基于链终止反应的原理,通过使用...
Sanger法测序是一种经典的DNA测序技术,由弗雷德·桑格(Frederick Sanger)在1975年首次提出。该方法基于链终止反应的原理,通过使用一组带有不同标记的脱氧核苷酸终止剂(dNTP),将待测DNA序列的每个位置都特异地标记上不同的荧光染料,从而确定DNA序列。Sanger法测序原理链终止反应Sanger法测序的核心是利用"链终止反应"来终止DNA的延伸。在这种反应中,特殊的dNTP(如d太平洋鲱蓝标记的dCTP和荧光染料标记的dATP、dGTP和dTTP)与标准的四种dNTP一起被加入到延伸中的DNA链中。由于这些特殊的dNTP不能与接下来的核苷酸形成磷酸二酯键,因此新加入的核苷酸将导致延伸的DNA链立即终止。每一种特殊的dNTP对应于一种荧光染料标记,这样就可以通过在特定波长下检测荧光信号来确定DNA链的长度和对应的核苷酸。四种不同终止剂的引入Sanger法测序使用了四种不同的荧光染料,每种对应于一个特定的终止剂(比如蓝色、绿色、红色和黄色,分别对应于dATP、dGTP、dCTP和dTTP)。这四种染料分别标记在四种不同的dNTP上,这样就可以通过在特定的波长下检测荧光信号来确定DNA链的长度和对应的核苷酸。凝胶电泳分离在链终止反应完成后,DNA样品会被添加到一种特殊的凝胶中,凝胶中的分子筛可以阻止大于一定大小的分子通过。然后,凝胶会被置于一个电场中以进行电泳分离。由于DNA链的大小不同,它们在凝胶中的移动速度也不同。较短的DNA链会比较长的DNA链移动得更快。通过将凝胶分成多个部分,并在每个部分进行荧光检测,就可以确定每个部分的DNA链是由哪些核苷酸组成的,从而得到完整的DNA序列。Sanger法测序步骤以下是Sanger法测序的基本步骤:准备样品首先,你需要准备要测序的DNA样品。这通常需要将DNA进行PCR扩增或者其它类型的体外扩增以获得足够的量设计引物你需要设计一对特异性的引物,用于在测序反应中引导DNA的延伸。引物通常是用化学合成的方法制备的链终止反应将四种不同的荧光染料标记的dNTP(包括四种标准dNTP)和引物加入到DNA模板中,然后在特定的温度和条件下进行延伸反应。每个dNTP都可以与待测DNA链上的特定核苷酸形成磷酸二酯键,但是荧光染料标记的dNTP由于缺乏一个特殊的基团而不能继续延伸链。因此,当加入荧光染料标记的dNTP时,延伸反应将立即终止凝胶电泳分离当所有的链终止反应都完成后,将样品加入到凝胶中,然后在电场中进行电泳分离。大小不同的DNA片段将在凝胶中以不同的速度移动荧光检测在电泳分离过程中或在凝胶通过电泳槽后,使用特定的荧光扫描仪在每个波长下检测凝胶中的荧光信号。这会生成一个关于每个荧光染料标记的DNA片段分布的图像数据分析最后,通过对荧光信号的分析和处理,可以得到每个凝胶部分的DNA序列。这些数据可以通过电脑进行自动解读和分析这就是Sanger法测序的基本原理和步骤。虽然最初的Sanger法测序过程比较繁琐和耗时,但是随着技术的进步,许多自动化和高通量的方法已经被开发出来,使得DNA测序变得更加高效和快速。例如,下一代测序(Next Generation Sequencing, NGS)技术已经成为当前最常用的DNA测序方法之一,它可以在短时间内产生大量的序列数据,而且成本更低。然而,Sanger法测序仍然是一种非常可靠和精确的技术,特别是在需要单分子分辨率或者长序列覆盖率的情况下。